• Văn phòng

Chánh Văn phòng: Đinh Phượng Trung

• Thanh tra

Chánh Thanh tra:

• Phòng Pháp chế

Trưởng phòng: Phan Thị Chiều

• Vụ Kế hoạch Tài chính

Vụ trưởng: Nguyễn Đức Thăng

• Cục Chính trị - Tổ chức

Cục trưởng: Đại tá Mã Việt Hùng

• Vụ Khoa học Công nghệ

Vụ trưởng: Nguyễn Thanh Bình

• Cục Chứng thực Số và Bảo mật Thông tin

Cục trưởng: Đặng Duy Mẫn

• Cục Cơ yếu Đảng - Chính quyền

Cục trưởng: Ngô Đức Thắng

• Cục Quản lý Kỹ thuật nghiệp vụ Mật mã

Cục trưởng: Đại tá Đào Xuân Long

• Học viện Kỹ thuật Mật mã

Giám đốc: Đại tá, TS. Nguyễn Hữu Hùng

• Viện Khoa học Công nghệ Mật mã

Viện trưởng: TS. Hoàng Văn Thức

• Cục Quản lý Mật mã Dân sự và Kiểm định Sản phẩm Mật mã

Cục trưởng: Đại tá, TS. Hồ Văn Hương

• Trung tâm Công nghệ Thông tin và Giám sát An ninh mạng

Giám đốc: Đại tá Trần Đức Sự

• Công ty TNHH một thành viên 129

Giám đốc: Phạm Mạnh Tuấn

• Nhà máy M2

Giám đốc: Đại tá Phạm Văn Hân

• Nhà máy 951

Giám đốc: Nguyễn Xuân Bình

• Tạp chí An toàn thông tin

Tổng biên tập: ThS. Nguyễn Như Tuấn

• Ban nghiên cứu tổng kết lịch sử Ngành

Trưởng ban: TS. Đào Hồng Nam